En el marco del proyecto CUBE, los socios alemanes trabajan estrechamente con tres socios centrales cubanos. Son subdepartamentos o estaciones de investigación de tres universidades cubanas diferentes. También está asociada una institución de capacitación y extensión perteneciente al Ministerio de la Agricultura cubano. En adición, participan actores claves relevantes para la elaboración de estrategias de bioeconomía que permitan procesos de desarrollo territorial socialmente equilibrados.